Das Fach Chemie wird am Phoenix in der Sekundarstufe I ab Klasse 7 und in der Gymnasialen Oberstufe in Grundkursen unterrichet. Bei genügender Anwahl durch die Schülerinnen und Schüler werden auch Leistungskurse eingerichtet.
Weiterhin bietet das Phoenix im Wahlpflichtbereich II (Klasse 8 und 9)
Biologie/Chemie an.
Das Fach Chemie wird in zwei Fachräumen unterrichtet. Die Ausstattungsmerkmale zum Experimentieren sind - vergleicht man die Dortmunder Schullandschaft - über dem Durchschnitt.